這是8月4日拍攝的福建向金門供水工程取水地——福建晉江龍湖。 新華社記者姜克紅攝
臺媒稱，金門首批自陸引水10萬噸，零關稅，但照課5%進口營業稅約4.9萬新臺幣，外界批評民進黨當局為德不卒。臺當局財政相關部門官員指出，金門水廠進口原水要課征加值型營業稅5%，賣水給民眾也會課稅，但兩者可扣抵，不論關稅或營業稅的課征都是依現制辦理。金門縣自來水廠表示，將配合要求，不會轉嫁到一般用戶。
據臺灣中時電子報8月9日報道，為了金門通水案，臺當局財政相關部門官員表示，為此首度設立了管線水的新稅號，雖民生用水屬零“關稅”，但要課營業稅5%。由于課稅后原本就比金門當地原水貴，水價成本又墊高。
據臺財政相關部門估算，以8月進口10萬噸，每噸單價9.86元新臺幣計算，課5%營業稅、約4.9萬元新臺幣。課稅對象是金門自來水廠。相關官員不諱言，若未來通電，也將研議是否設立獨立稅號，以及是否課關稅與營業稅。
報道稱，面對臺當局阻通水儀式，現又祭出大陸進口水也要課5%營業稅，墊高水價成本，引來抨擊。
金門縣自來水廠長許正芳表示，未來將依相關規定，配合辦理，依據當月通水的實際流量噸數，委托本地報關行申請報關；自陸引水在于改善民生，照顧鄉親，5%營業稅不會轉嫁到用戶。
